Plasmide CRISPR/Cas9 KO SETMAR (h): sc-417901

Présentation

SETMAR (également appelé Metnase) est une lysine méthyltransférase humaine contenant un domaine SET, fusionnée à un domaine dérivé d’une transposase de type mariner, qui coordonne les modifications de la chromatine avec le traitement des extrémités d’ADN. Elle participe à la réparation des cassures double brin de l’ADN et au maintien du génome en modulant la jonction d’extrémités non homologues (NHEJ) et en influençant les réponses au stress associé à la réplication. Par ses interactions avec des facteurs de réparation et des composants de la chromatine, SETMAR peut affecter la régulation transcriptionnelle et l’accessibilité de la chromatine aux sites de dommages. Une activité ou une expression dérégulée de SETMAR a été associée à une capacité de réparation de l’ADN altérée et à une instabilité génomique, ce qui en fait une cible pertinente pour l’étude de la biologie du cancer, de la radiosensibilité et des mécanismes de réponse aux médicaments.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SETMAR (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SETMAR dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SETMAR, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SETMAR à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SETMAR.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SETMAR pour l'étude de la signalisation de SETMAR, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SETMAR essentiels à la fonction de SETMAR
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SETMAR pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SETMAR plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SETMAR plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SETMAR. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SETMAR plasmide HDR (h) et le SETMAR (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SETMAR pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SETMAR définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.