Plasmide CRISPR/Cas9 KO SCML1 (h): sc-407161

Présentation

SCML1 (sex comb on midleg-like 1) code une protéine associée au groupe Polycomb, impliquée dans la répression transcriptionnelle dépendante de la chromatine et le maintien des états épigénétiques. En tant que membre de la famille SCM, SCML1 est lié à la biologie des complexes répressifs Polycomb et contribue à une régulation des programmes d’expression génique guidée par les marques d’histones, influençant l’identité cellulaire et les processus de développement. Une altération de l’activité de la voie Polycomb est largement pertinente dans les défauts de différenciation et les déséquilibres transcriptionnels à l’échelle du génome observés dans de multiples contextes pathologiques, ce qui fait de SCML1 un nœud utile pour étudier les mécanismes de contrôle épigénétique. L’étude de SCML1 soutient la recherche sur l’organisation de la chromatine, le silence transcriptionnel et les effets en aval sur les réseaux de gènes spécifiques de lignée.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SCML1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SCML1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SCML1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SCML1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SCML1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SCML1 pour l'étude de la signalisation de SCML1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SCML1 essentiels à la fonction de SCML1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SCML1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SCML1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SCML1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SCML1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SCML1 plasmide HDR (h) et le SCML1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SCML1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SCML1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.