OTUB2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-413099

Descripción general

OTUB2 (desubiquitinasa OTU, unión al aldehído de ubiquitina 2) codifica una desubiquitinasa tipo proteasa de cisteína que edita señales de ubiquitina para regular la estabilidad de las proteínas y la amplitud de la señalización. Al escindir de forma preferente enlaces específicos de cadenas de ubiquitina, OTUB2 influye en vías dependientes de ubiquitina que controlan la proteostasis, las respuestas al daño del ADN y cascadas de señalización adaptativas al estrés. La actividad alterada de OTUB2 se ha relacionado con la desregulación de la homeostasis de la ubiquitina observada en múltiples contextos patológicos, incluidos programas de señalización oncogénica y la fisiopatología inflamatoria. Como resultado, OTUB2 se estudia con frecuencia por su impacto en la intercomunicación entre la ubiquitinación, el control transcripcional y las decisiones de supervivencia celular.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO OTUB2 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen OTUB2 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del OTUB2 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de OTUB2 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína OTUB2.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en OTUB2 para la investigación de la señalización de OTUB2, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de OTUB2 críticos para la función de OTUB2
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de OTUB2 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido OTUB2 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido OTUB2 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus OTUB2. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR OTUB2 (h) y el plásmido HDR OTUB2 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología OTUB2 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana OTUB2 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.