Les oligonucléotides Oct-1 Gel Shift sont de courtes séquences d'ADN conçues pour être utilisées dans les essais de gel shift, une technique fondamentale en biologie moléculaire utilisée pour étudier les interactions protéine-ADN. Ces oligonucléotides sont dérivés de la séquence de liaison consensus du facteur de transcription Oct-1, qui appartient à la famille des facteurs de transcription à domaine POU (Pit-Oct-Unc). Oct-1 joue un rôle crucial dans la régulation de l'expression des gènes en se liant à des séquences d'ADN spécifiques, connues sous le nom de motifs octamères, situées dans les promoteurs des gènes cibles. En se liant à ses sites cibles, l'Oct-1 peut activer ou réprimer la transcription des gènes, en fonction du contexte et de son interaction avec d'autres protéines régulatrices. En utilisant des oligonucléotides Oct-1 Gel Shift dans des essais de gel shift, les chercheurs peuvent étudier la cinétique de liaison, la spécificité et l'affinité de l'Oct-1 pour les motifs octamères dans diverses conditions expérimentales. Cette technique permet d'élucider les mécanismes moléculaires qui sous-tendent la régulation des gènes par l'Oct-1 et donne un aperçu des réseaux de signalisation complexes qui régissent les processus cellulaires tels que le développement, la différenciation et la prolifération.
Références:
- Le facteur de transcription octamère 1 renforce l'activation du promoteur de l'UDP glucuronosyltransférase 2B7 humaine par le facteur nucléaire hépatique 1 alpha. | Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
- Liaison allèle-spécifique du facteur de transcription ubiquitaire OCT-1 aux sites de polymorphisme nucléotidique unique (SNP) fonctionnels dans le promoteur du gène du facteur de nécrose tumorale alpha (TNFA). | Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
- Liaison des facteurs octamères à l'IL-5 CLE0 murine dans les cellules T primaires et une lignée de cellules T. | Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
- Les inhibiteurs de la 3-Hydroxy-3-méthylglutaryl coenzyme A réductase augmentent l'activité de liaison et le niveau nucléaire d'Oct-1 dans les cellules mononucléaires. | Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
- Implication de Oct-1 dans la régulation transcriptionnelle de l'expression du gène de la bêta-caséine dans la glande mammaire de la souris. | Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
- Les protéines homéodomaines TALE régulent l'expression génétique de l'hormone de libération de la gonadotrophine de manière indépendante et par le biais d'interactions avec Oct-1. | Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
- Oct-1 et le facteur nucléaire Y se lient à l'élément SURG-1 pour diriger la transcription basale et stimulée par l'hormone de libération de la gonadotrophine (GnRH) du gène du récepteur de la GnRH chez la souris. | Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
- Le triptolide, un composant actif de la plante médicinale chinoise Tripterygium wilfordii Hook F, inhibe la production d'oxyde nitrique en diminuant la transcription du gène de l'oxyde nitrique synthase inductible. | Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
- Régulation du promoteur du gène CYP4A2 du rat par c-Jun et la protéine de liaison octamère-1. | Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
- Association de la concentration sérique d'interleukine-6 avec un polymorphisme fonctionnel IL6 -6331T>C. | Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
- La lamine B1 contrôle les réponses au stress oxydatif par l'intermédiaire d'Oct-1. | Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
- Un motif Oct-1 très en amont régule la transcription induite par les cytokines du gène de l'oxyde nitrique synthase inductible humain. | Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
- L'activité transcriptionnelle de l'enhancer du papillomavirus humain de type 31b est régulée par l'interaction synergique d'AP1 avec deux nouveaux facteurs cellulaires. | Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
- Oct-1 lie les éléments du promoteur nécessaires à la transcription du gène GnRH. | Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983