Plasmide CRISPR/Cas9 KO NRIP3 (h): sc-412715

Présentation

NRIP3 (nuclear receptor interacting protein 3) code une protéine nucléaire dont il a été rapporté qu’elle interagit avec la machinerie transcriptionnelle associée aux récepteurs nucléaires, ce qui suggère un rôle dans la modulation des programmes transcriptionnels qui gouvernent les décisions d’état cellulaire. Par ces interactions, NRIP3 est impliquée dans des réseaux de signalisation liés à la régulation de gènes sensibles aux hormones, aux processus associés à la chromatine et au contrôle, dépendant du contexte, de la prolifération et de la différenciation. Une régulation altérée des voies des récepteurs nucléaires et des co‑régulateurs transcriptionnels est fréquemment impliquée dans le remodelage oncogénique des programmes transcriptionnels et dans d’autres phénotypes pathologiques complexes, ce qui fait de NRIP3 une cible utile pour des études mécanistiques de la régulation génique. L’étude fonctionnelle de NRIP3 peut aider à définir comment la transcription couplée aux récepteurs nucléaires s’intègre à une signalisation cellulaire plus large pour façonner l’expression génique en aval.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO NRIP3 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène NRIP3 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du NRIP3, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert NRIP3 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine NRIP3.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en NRIP3 pour l'étude de la signalisation de NRIP3, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de NRIP3 essentiels à la fonction de NRIP3
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de NRIP3 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le NRIP3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le NRIP3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus NRIP3. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le NRIP3 plasmide HDR (h) et le NRIP3 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie NRIP3 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles NRIP3 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.