Plasmide CRISPR/Cas9 KO MTA1 (h): sc-400942

Présentation

MTA1 (metastasis associated 1) code un corégulateur associé à la chromatine et un composant clé du complexe NuRD (remodelage des nucléosomes et désacétylation), qui intègre le remodelage des nucléosomes dépendant de l’ATP à la désacétylation des histones afin de façonner les programmes transcriptionnels. Par ses interactions avec HDAC1/2, CHD4 et des facteurs de transcription spécifiques de séquence, MTA1 influence la transition épithélio‑mésenchymateuse, les réponses aux dommages de l’ADN, la signalisation des récepteurs hormonaux et la régulation du cycle cellulaire. Des altérations de l’expression ou de l’activité de MTA1 ont été associées à la progression tumorale et à des phénotypes invasifs dans de nombreux types de cancers, où MTA1 peut moduler des voies oncogéniques et de différenciation. En tant que régulateur nucléaire de l’état de la chromatine, MTA1 est fréquemment étudié pour ses rôles dans la dynamique de répression/activation transcriptionnelle, la plasticité épigénétique et les mécanismes d’expression génique associés aux métastases.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO MTA1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène MTA1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du MTA1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert MTA1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine MTA1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en MTA1 pour l'étude de la signalisation de MTA1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de MTA1 essentiels à la fonction de MTA1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de MTA1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le MTA1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le MTA1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus MTA1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le MTA1 plasmide HDR (h) et le MTA1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie MTA1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles MTA1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.