HoxC11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406796
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- HoxC11 Das CRISPR/Cas9-Knockout (KO)-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, von denen jedes für die Cas9-Nuklease und eine zielspezifische 20-nt-Guide-RNA (gRNA) kodiert, die für maximale Knockout-Effizienz unter Verwendung von Sequenzen aus der GeCKO v2-Bibliothek entwickelt wurde
- gRNA-Sequenzen lenken Cas9 so, dass es ortsspezifische Doppelstrangbrüche (DSBs) im HoxC11-Genomlokus induziert, was zu einem Gen-Knockout durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ) führt
- Die Puromycin-Resistenz- und RFP-Gene werden von LoxP-Stellen flankiert, was die Entfernung der Selektionsmarker mittels Cre-Rekombinase (Cre-Vektor: sc-418923) nach der Etablierung stabiler Knockout-Zelllinien ermöglicht
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: HoxC11: sc-81293
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
HoxC11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) | sc-406796 | 20 µg | $397.00 |
Übersicht
HOXC11 kodiert den Homeobox-Transkriptionsfaktor HoxC11, einen DNA-bindenden Regulator, der während der Entwicklung zur anterior-posterioren Musterbildung und zur regionalen Identität beiträgt, indem er über sequenzspezifische Kontrolle von Genexpressionsprogrammen wirkt. In differenzierten Geweben kann HoxC11 zelluläre Differenzierungszustände und linienassoziierte transkriptionelle Netzwerke beeinflussen, wobei er mit Kofaktoren und der chromatinregulatorischen Maschinerie interagiert, um kontextabhängige Transkription zu steuern. Eine fehlregulierte HOXC11-Expression wurde in mehreren Tumorkontexten beschrieben und wird häufig im Rahmen umfassenderer Veränderungen von HOX-Gen-Netzwerken untersucht, die Proliferation, Invasion und zelluläre Plastizität beeinflussen. Als transkriptioneller Regulator ist HoxC11 relevant für Untersuchungen zu entwicklungsbiologischen genregulatorischen Schaltkreisen, zur epigenetischen Kontrolle der Zellidentität und zur onkogenen Reprogrammierung.
Das HoxC11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HOXC11-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HOXC11-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.
Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HOXC11 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die HoxC11-Proteinexpression aufheben.
Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HOXC11-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der HoxC11-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.
Hauptmerkmale
- sgRNAs, die auf HOXC11-Exone abzielen, die für die HoxC11-Funktion entscheidend sind
Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
Pool von Plasmiden, die auf mehrere HOXC11-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion
Designvarianten
CRISPRs +/- HDRs
- gRNAs, die vom HoxC11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom HoxC11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HOXC11-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das HoxC11 HDR-Plasmid (h) und HoxC11 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HOXC11-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HOXC11-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.