hnRNP C1/C2 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-420894

Descripción general

Hnrnpc codifica la ribonucleoproteína nuclear heterogénea C1/C2 (hnRNP C1/C2), unas abundantes proteínas nucleares de unión a ARN que se ensamblan sobre los pre-ARNm para empaquetar los transcritos nacientes y determinar el destino del ARN. hnRNP C participa en la selección cotranscripcional de sitios de empalme, el procesamiento del extremo 3′ del ARNm y las decisiones de retención/exportación nuclear, y ayuda a mantener la integridad del transcriptoma al antagonizar la exonización inapropiada de elementos Alu y otros eventos de empalme críptico. A través de estas funciones, Hnrnpc se integra con las vías centrales del metabolismo del ARN e influye en programas de expresión génica vinculados a la proliferación, la diferenciación y las respuestas celulares al estrés. La desregulación de hnRNP C se ha asociado en la literatura con paisajes de empalme alterados observados en modelos relevantes para el cáncer y la neurodegeneración, lo que la convierte en un nodo frecuente para estudiar defectos en el procesamiento del ARN.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO hnRNP C1/C2 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Hnrnpc en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Hnrnpc junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Hnrnpc tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína hnRNP C1/C2.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Hnrnpc para la investigación de la señalización de hnRNP C1/C2, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Hnrnpc críticos para la función de hnRNP C1/C2
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Hnrnpc para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Hnrnpc. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR hnRNP C1/C2 (m) y el plásmido HDR hnRNP C1/C2 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Hnrnpc para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Hnrnpc definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.