Plasmide CRISPR/Cas9 KO Histone Deacetylase 1 (HDAC1) (r): sc-437285

Présentation

L’histone désacétylase 1 (HDAC1) est une désacétylase de lysine de classe I qui enlève des groupements acétyle des queues d’histones afin de favoriser la compaction de la chromatine et la répression transcriptionnelle. Dans les cellules de rat, HDAC1 agit au sein de complexes corépresseurs multiprotéiques tels que NuRD, Sin3 et CoREST, en coordonnant le contrôle épigénétique de programmes d’expression génique qui régulent la progression du cycle cellulaire, la différenciation et les réponses aux dommages de l’ADN. En remodelant l’accessibilité de la chromatine, HDAC1 influence des voies liées au stress de réplication, au contrôle des points de contrôle (checkpoints) et à des réseaux transcriptionnels spécifiques de lignée. Une activité d’HDAC1 dérégulée et des états d’acétylation des histones altérés sont fréquemment étudiés dans des modèles de transformation oncogénique, de phénotypes neurodéveloppementaux et de signalisation inflammatoire, où un déséquilibre épigénétique contribue à des changements d’expression génique associés à la maladie.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO Histone Deacetylase 1 (HDAC1) (r) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène dans les lignées cellulaires rat. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du , ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine Histone Deacetylase 1 (HDAC1).

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en pour l'étude de la signalisation de Histone Deacetylase 1 (HDAC1), les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de essentiels à la fonction de Histone Deacetylase 1 (HDAC1)
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le Histone Deacetylase 1 (HDAC1) plasmide CRISPR/Cas9 KO (r) et le Histone Deacetylase 1 (HDAC1) plasmide CRISPR/Cas9 KO (r2) ciblent des sites distincts au sein du locus . Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le Histone Deacetylase 1 (HDAC1) plasmide HDR (r) et le Histone Deacetylase 1 (HDAC1) (r2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.