Plasmide CRISPR/Cas9 KO GATAD1 (h): sc-403468

Présentation

GATAD1 (GATA zinc finger domain containing 1) code une protéine nucléaire associée à la chromatine, impliquée dans la régulation transcriptionnelle via la liaison à l’ADN et des interactions protéine–protéine. Grâce à son domaine à doigt de zinc, GATAD1 est liée au contrôle de programmes d’expression génique qui influencent la prolifération cellulaire, la différenciation et les réponses adaptatives au stress, souvent en coordination avec des modificateurs épigénétiques et des complexes de remodelage de la chromatine. Une expression altérée de GATAD1 ou des variations de son nombre de copies ont été rapportées dans plusieurs contextes tumoraux, ce qui soutient l’intérêt pour sa contribution à des états transcriptionnels oncogéniques et à des perturbations des réseaux de régulation à l’échelle du génome. Par conséquent, GATAD1 est fréquemment étudiée dans le cadre des mécanismes de régulation de la chromatine, des circuits de facteurs de transcription et des interactions entre voies de signalisation pertinentes en cancérologie.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO GATAD1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène GATAD1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du GATAD1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert GATAD1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine GATAD1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en GATAD1 pour l'étude de la signalisation de GATAD1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de GATAD1 essentiels à la fonction de GATAD1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de GATAD1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le GATAD1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le GATAD1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus GATAD1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le GATAD1 plasmide HDR (h) et le GATAD1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie GATAD1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles GATAD1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.