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EDEM Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-401946-ACT | 20 µg | $397.00 |
L’EDEM1 umano codifica la proteina 1 simile a un’α-mannosidasi che potenzia la degradazione nel reticolo endoplasmatico (EDEM), un fattore di controllo qualità del reticolo endoplasmatico che accelera la degradazione associata al RE (ERAD) delle glicoproteine mal ripiegate. EDEM1 partecipa al riconoscimento dei substrati dipendente dal trimming del mannosio e indirizza le proteine anomale dal ciclo di ripiegamento calnexina/calreticulina verso la retrotraslocazione e la degradazione proteasomiale, integrandosi con la risposta alle proteine mal ripiegate (UPR) e con le reti di proteostasi del RE. Grazie al suo ruolo nella risoluzione dello stress proteotossico, EDEM1 è rilevante per vie coinvolte nel carico secretorio, nella segnalazione dello stress ossidativo e del RE e in alterazioni collegate alla biologia del cancro, alla neurodegenerazione e ai meccanismi delle malattie metaboliche.
EDEM Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di EDEM1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
EDEM Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus EDEM1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione EDEM1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di EDEM. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus EDEM1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da EDEM nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via EDEM nelle cellule tumorali con espressione di EDEM1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.