DDX21 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h2): sc-405770-KO-2

Panoramica

DDX21 è un’elicasi dell’RNA di tipo DEAD-box localizzata nel nucleolo che coordina la maturazione dell’rRNA, la biogenesi dei ribosomi e, più in generale, il metabolismo dell’RNA attraverso il rimodellamento di complessi RNA–proteina. Partecipa alle risposte allo stress nucleolare e si interfaccia con programmi trascrizionali che collegano i segnali di crescita alla capacità di sintesi proteica, influenzando la progressione del ciclo cellulare e la proteostasi. DDX21 è stata inoltre implicata nella segnalazione dell’immunità innata modulando vie dipendenti dall’RNA e l’espressione di geni stimolati dall’interferone. Una funzione di DDX21 deregolata e una biogenesi ribosomiale alterata vengono spesso studiate nel contesto della trasformazione oncogena, dello stress genomico e della biologia delle infezioni virali.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO DDX21 (h2) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene DDX21 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del DDX21 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto DDX21 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina DDX21.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di DDX21 per lo studio della segnalazione di DDX21, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni DDX21 critici per la funzione di DDX21
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di DDX21 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal DDX21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal DDX21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus DDX21. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal DDX21 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR DDX21 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia DDX21 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio DDX21 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.