DDX11 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-418103

Übersicht

DDX11 (DEAD/H-Box-Helikase 11), auch bekannt als ChlR1, ist eine DNA-Helikase, die die Genomstabilität unterstützt, indem sie die Kohäsion der Schwesterchromatiden und eine effiziente DNA-Replikation fördert. Sie ist an replikationsgekoppelter DNA-Reparatur und der Progression der Replikationsgabel beteiligt und steht dabei in Verbindung mit der Etablierung der Kohäsion sowie umfassenderen Signalwegen der DNA-Schadensantwort. Die Aktivität von DDX11 hilft, chromosomale Brüche und Aneuploidie infolge von Replikationsstress zu verhindern, und verknüpft ihre Funktion damit mit Mechanismen, die die Chromosomensegregation absichern. Genetische Störungen oder Funktionsdefekte von DDX11 sind mit kohäsinbezogenen Phänotypen genomischer Instabilität assoziiert, darunter das Warsaw-Breakage-Syndrom, und sind daher relevant für die Untersuchung von Kohäsionsdefekten und replikationsassoziierten DNA-Schäden.

Das DDX11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des DDX11-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des DDX11-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von DDX11 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die DDX11-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von DDX11-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der DDX11-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf DDX11-Exone abzielen, die für die DDX11-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere DDX11-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom DDX11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom DDX11 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des DDX11-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das DDX11 HDR-Plasmid (h) und DDX11 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von DDX11-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten DDX11-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.