DDRGK1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-413090

Descripción general

DDRGK1 (DDRGK domain containing 1; también conocida como UFBP1) es un componente esencial del sistema de conjugación de UFM1, que sostiene la homeostasis del retículo endoplásmico (RE) y el control de calidad de las proteínas. Esta proteína participa en la UFMilación en el RE, conectando procesos asociados a los ribosomas y la degradación asociada al RE con la adaptación celular al estrés, incluida la respuesta a proteínas desplegadas. A través de estas vías, DDRGK1 influye en la proteostasis, la supervivencia celular bajo estrés del RE y la coordinación del manejo de proteínas secretoras. La desregulación de factores de la vía de UFM1, incluida DDRGK1, se ha asociado con vulnerabilidad celular en contextos como la disfunción hematopoyética y la biología de enfermedades relacionadas con el estrés, lo que la convierte en un objetivo útil para estudios mecanísticos.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO DDRGK1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen DDRGK1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del DDRGK1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de DDRGK1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína DDRGK1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en DDRGK1 para la investigación de la señalización de DDRGK1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de DDRGK1 críticos para la función de DDRGK1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de DDRGK1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido DDRGK1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido DDRGK1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus DDRGK1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR DDRGK1 (h) y el plásmido HDR DDRGK1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología DDRGK1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana DDRGK1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.