DDB1 CRISPR Activation Plasmid (m): sc-419966-ACT

Maus-DDB1 (damage specific DNA binding protein 1) ist ein zentraler Adapter des CUL4–DDB1-E3-Ubiquitin-Ligase-Komplexes, der den ubiquitinabhängigen Abbau regulatorischer Proteine koordiniert, die an der Aufrechterhaltung der Genomintegrität beteiligt sind. Es wirkt an der Nukleotid-Exzisionsreparatur, der Lizenzierung der DNA-Replikation, dem Chromatin-Remodeling und der Zellzyklusprogression mit, indem es Substratrezeptoren zusammenführt und nach genotoxischem Stress die Proteostase moduliert. Über diese Signalwege beeinflusst DDB1 Replikationsstress-Antworten und Transkriptionsprogramme, die mit zellulärer Proliferation und Differenzierung verknüpft sind. Eine Fehlregulation der DDB1-assoziierten Ubiquitin-Signalgebung und der DNA-Reparaturnetzwerke wird häufig in Modellen genomischer Instabilität und krebsrelevanter Biologie untersucht.

DDB1 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (m) bietet einen gezielten, nicht-destruktiven Ansatz zur Hochregulierung der endogenen Ddb1-Expression, ohne die zugrunde liegende DNA-Sequenz zu verändern.

DDB1 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (m) ist ein aus drei Plasmiden bestehendes synergistisches Aktivierungsmediator-System (SAM), das für eine hocheffiziente, ortsspezifische transkriptionelle Hochregulation des Ddb1-Lokus in menschlichen Zelllinien entwickelt wurde. Das System basiert auf einem katalytisch inaktiven Cas9 (dCas9), das zwei inaktivierende Mutationen (D10A und N863A) trägt, welche die Nukleaseaktivität eliminieren, während die DNA-Bindung erhalten bleibt. Dieses dCas9 ist mit VP64, einem potenten Transkriptionsaktivator, fusioniert und wird zusammen mit einem Blasticidin-Resistenzgen zur Selektion koexprimiert. Das zweite Plasmid kodiert das MS2-p65-HSF1-Fusionsprotein, einen sekundären Aktivatorkomplex, der zusammen mit dCas9-VP64 wirkt, sowie ein Hygromycin-Resistenzgen. Das dritte Plasmid kodiert für eine zielspezifische 20-nt-sgRNA, die an zwei MS2-RNA-Aptamere fusioniert ist, welche den MS2-p65-HSF1-Komplex an die Aktivierungsstelle rekrutieren, begleitet von einem Puromycin-Resistenzgen. Die drei Plasmide werden im Massenverhältnis 1:1:1 verabreicht, um eine ausgewogene Expression aller Systemkomponenten zu gewährleisten.

Nach der Assemblierung am Zielort bindet der SAM-Komplex etwa 200 bp stromaufwärts der Ddb1-Transkriptionsstartstelle, wo VP64, p65 und HSF1 gemeinsam die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren und die Hochregulation der endogenen DDB1-Expression vorantreiben. Im Gegensatz zu nukleaseaktivem Cas9 verursacht dCas9 keine Doppelstrangbrüche und verändert die genomische Sequenz nicht, wodurch der native Ddb1-Locus erhalten bleibt und die Untersuchung von DDB1-abhängigen Transkriptionsreaktionen am endogenen Locus ermöglicht wird. Dies macht es zu einem wertvollen Werkzeug für Funktionsstudien, die Identifizierung von Zielgenen und die Modellierung der Wiederherstellung des DDB1-Signalwegs in Tumorzellen mit stillgelegtem oder reduziertem Ddb1-Ausdruck.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.