Cytokeratin 16 Double Nickase Plasmid (h): sc-403138-NIC
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- Das Cytokeratin 16 Double Nickase Plasmid (h) wird als Plasmid-Paar geliefert. Die einzelnen Plasmide kodieren für eine D10A mutierte Cas9 Nuklease sowie für je eine unterschiedliche, zielspezifische 20nt guide RNA (gRNA) Sequenz. Dies erlaubt eine hohe Knockout-Effizienz bei gleichzeitig größerer Spezifität als das entsprechende CRISPR/Cas9 KO Plasmid
- gRNA Sequenzpaare liegen ca. 20 bp auseinander um ein spezifisches Cas9-vermitteltes "Double Nicking" der genomischen DNA zu erlauben und so im Resultat den Effekt eines Doppelstrangbruchs nachzuahmen.
- Ein Plasmid kodiert für ein Puromycin-Resistenzgen zur Selektion von stabilen Knockout-Zellen. Das andere Plasmid kodiert für ein GFP-Gen für den visuellen Nachweis der Transfektion
- Cytokeratin 16 Double-Nickase-Plasmid (h) und Cytokeratin 16 Double-Nickase-Plasmid (h2) kodieren unterschiedliche gepaarte gRNA-Designs, die auf KRT16 abzielen. Möglicherweise ist eines oder sind beide Designs verfügbar
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: Cytokeratin 16: sc-377224
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
Cytokeratin 16 Double Nickase Plasmid (h) | sc-403138-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
Cytokeratin 16 Double Nickase Plasmid (h2) | sc-403138-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
KRT16 kodiert Zytokeratin 16, ein Intermediärfilamentprotein vom Typ I, das mit Typ-II-Keratinen Heterodimere bildet, um das Keratin-Zytoskelett in mehrschichtigen Epithelien aufzubauen. Zytokeratin 16 wird bei Aktivierungszuständen der Epidermis rasch induziert und unterstützt die mechanische Belastbarkeit, die Umgestaltung des Zytoskeletts sowie koordinierte Veränderungen der Proliferation und Migration von Keratinozyten im Rahmen von Barrierebelastung und wundassoziierten Programmen. Es ist an Adhäsions- und Stressantwortprozesse gekoppelt, einschließlich der Organisation von Zytoskelett und Desmosomen sowie der Dynamik des Keratinnetzwerks, die die epitheliale Integrität prägen. Eine dysregulierte KRT16-Expression oder Filamentassemblierung wird mit hyperproliferativen Hautphänotypen und Verhornungsstörungen in Verbindung gebracht, wodurch KRT16 ein nützliches Ziel für die Untersuchung epithelialer Stresssignalwege und differenzierungsassoziierter Zytoskelett-Remodellierung ist.
Cytokeratin 16 Das Double-Nickase-Plasmid (h) besteht aus einem aufeinander abgestimmten Plasmidpaar, das für die hochspezifische Bearbeitung des KRT16-Lokus in human-Zelllinien entwickelt wurde. Jedes Plasmid exprimiert eine Cas9-D10A-Nickase und eine spezifische sgRNA, die auf entgegengesetzte DNA-Stränge innerhalb von KRT16 abzielt. Wenn sie auf benachbarte Stellen auf entgegengesetzten DNA-Strängen gerichtet sind, erzeugen die beiden Nickasen versetzte Einzelstrang-Schnitte, die zusammen einen versetzten Doppelstrangbruch erzeugen, was eine koordinierte On-Target-Aktivität beider Guides erfordert. Der resultierende DNA-Bruch wird durch endogene zelluläre Reparaturwege behoben, meist durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ), was zu Insertionen oder Deletionen führt, die die KRT16-Funktion stören. Durch die Notwendigkeit einer doppelten sgRNA-Bindung am Zielort erhöht der Doppel-Nick-Ansatz die Spezifität der Bearbeitung und bietet eine komplementäre CRISPR-Strategie für Anwendungen, bei denen eine zusätzliche Kontrolle über die Zielgenauigkeit gewünscht ist.
Um eine effiziente Identifizierung editierter Zellen zu unterstützen, kodiert ein Plasmid GFP zur fluoreszierenden Visualisierung transfizierter Populationen, während das Begleitplasmid ein Puromycin-Resistenzgen für die Antibiotika-Selektion trägt. Zusammen unterstützen diese Merkmale eine effiziente Anreicherung co-transfizierter Populationen und vereinfachen die Validierung von Klonen mit KRT16-Störung.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.