CLEC-3A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-417520

Übersicht

CLEC3A kodiert CLEC-3A, ein sezerniertes Protein mit C‑Typ‑Lektin-Domäne, das an der Organisation der extrazellulären Matrix und der Zell–Matrix-Kommunikation beteiligt ist. CLEC-3A wurde mit der Modulation von Kollagen-Interaktionen und Gewebeumbauprozessen in Verbindung gebracht, die mit Adhäsion, Migration und der Signalgebung in entzündlichen Mikroumgebungen verknüpft sind. In menschlichen Geweben wurde eine veränderte CLEC3A-Expression in Zusammenhängen wie Fibrose, Wundheilung und tumorassoziiertem Stroma beschrieben, was seinen Einsatz als Marker und als mechanistischen Knotenpunkt in umbaugetriebenen Phänotypen stützt. Diese Eigenschaften machen CLEC3A relevant für die Untersuchung, wie lektinähnliche Proteine extrazelluläre Signale formen, die epithelial–mesenchymales Verhalten und die Rekrutierung bzw. Migration von Immunzellen beeinflussen.

Das CLEC-3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des CLEC3A-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des CLEC3A-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von CLEC3A nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die CLEC-3A-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von CLEC3A-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der CLEC-3A-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf CLEC3A-Exone abzielen, die für die CLEC-3A-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere CLEC3A-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom CLEC-3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom CLEC-3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des CLEC3A-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das CLEC-3A HDR-Plasmid (h) und CLEC-3A HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von CLEC3A-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten CLEC3A-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.