Plasmide Double Nickase (h) CD362/SDC2/Syndecan-2: sc-401392-NIC

SDC2 code le syndécane-2 (CD362), un protéoglycane transmembranaire à héparane sulfate qui organise les interactions cellule–matrice en se liant, à la surface cellulaire, à des composants de la matrice extracellulaire et à des facteurs de croissance. Via ses chaînes d’héparane sulfate et son motif cytoplasmique de liaison aux domaines PDZ, le syndécane-2 influence l’adhésion dépendante des intégrines, la dynamique des adhésions focales et le remodelage du cytosquelette d’actine, avec des effets sur la migration et la prolifération. SDC2 participe à des réseaux de signalisation incluant les voies liées à FGF, VEGF et Wnt en modulant la disponibilité des ligands et l’assemblage des complexes de récepteurs, avec des effets en aval sur les voies MAPK/ERK et PI3K-AKT. Une expression dérégulée de SDC2 ou son clivage (shedding) a été associée à des interactions stromales altérées et à des phénotypes invasifs dans plusieurs cancers, ce qui en fait une cible pertinente pour l’étude du dialogue au sein du microenvironnement tumoral, de la signalisation angiogénique et des comportements cellulaires associés aux métastases.

CD362/SDC2/Syndecan-2 Le plasmide double nickase (h) se compose d'une paire de plasmides appariés, conçus pour une édition hautement spécifique du locus SDC2 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide exprime une nickase Cas9 D10A et un sgRNA distinct ciblant des brins d'ADN opposés au sein de SDC2. Lorsqu'elles sont dirigées vers des sites adjacents sur des brins d'ADN opposés, les deux nickases génèrent des cassures simple brin décalées qui, ensemble, produisent une cassure double brin décalée, nécessitant une activité coordonnée sur la cible de la part des deux guides. La cassure d'ADN qui en résulte est résolue par les voies de réparation cellulaires endogènes, le plus souvent par jonction non homologue (NHEJ), ce qui conduit à des insertions ou des délétions qui perturbent la fonction de SDC2. En nécessitant l'engagement de deux ARNsg au locus cible, l'approche par double nick améliore la spécificité de l'édition et offre une stratégie CRISPR complémentaire pour les applications où un contrôle supplémentaire de la précision du ciblage est souhaité.

Afin de faciliter l'identification efficace des cellules éditées, un plasmide code pour la GFP permettant la visualisation par fluorescence des populations transfectées, tandis que le plasmide compagnon porte un gène de résistance à la puromycine pour la sélection antibiotique. Ensemble, ces caractéristiques favorisent l'enrichissement efficace des populations co-transfectées et simplifient la validation des clones présentant une perturbation de SDC2.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.