cadherin-19 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-401716

Übersicht

CDH19 kodiert Cadherin-19, ein calciumabhängiges Zell-Zell-Adhäsionsmolekül, das zur Gewebearchitektur und zur kontaktvermittelten Signalübertragung beiträgt. Als Mitglied der klassischen Cadherin-Familie unterstützt Cadherin-19 die Organisation von Adherens Junctions durch Interaktionen mit Cateninen und die Kopplung an das Aktin-Zytoskelett und beeinflusst dadurch Prozesse wie Zellpolarität, Migration und Differenzierung. Eine CDH19-Expression wurde in neuronalen und glialen Linien beschrieben, in denen cadherinvermittelte Adhäsion die Entwicklungsmusterung und zelluläre Interaktionen prägen kann. Eine fehlregulierte Cadherin-Expression und ein Umbau von Zellkontakten sind in Krankheitskontexten häufig mit veränderter Invasivität und Linienidentität verbunden, wodurch CDH19 ein nützliches Ziel für die Untersuchung adhäsionsabhängiger Phänotypen darstellt.

Das cadherin-19 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des CDH19-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des CDH19-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von CDH19 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die cadherin-19-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von CDH19-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der cadherin-19-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf CDH19-Exone abzielen, die für die cadherin-19-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere CDH19-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom cadherin-19 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom cadherin-19 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des CDH19-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das cadherin-19 HDR-Plasmid (h) und cadherin-19 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von CDH19-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten CDH19-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.