BATF2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-403270

Panoramica

BATF2 (basic leucine zipper ATF-like transcription factor 2) è un fattore di trascrizione inducibile dagli interferoni che modula programmi di espressione genica a valle della segnalazione di citochine e dell’immunità innata. Nelle cellule umane, BATF2 partecipa alla regolazione delle risposte infiammatorie e della presentazione dell’antigene, con collegamenti funzionali alle reti trascrizionali guidate da JAK/STAT e IRF che determinano gli stati di attivazione di macrofagi e cellule dendritiche. È stato studiato come regolatore dipendente dal contesto della crescita cellulare, della differenziazione e dell’apoptosi, riflettendo la sua capacità di riorientare gli output trascrizionali durante lo stress cellulare. Alterazioni dell’espressione o dell’attività di BATF2 sono state associate a disregolazione immunitaria e a processi oncogenici, a supporto della sua utilità come nodo molecolare per analizzare il crosstalk tra infiammazione e tumore.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO BATF2 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene BATF2 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del BATF2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto BATF2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina BATF2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di BATF2 per lo studio della segnalazione di BATF2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni BATF2 critici per la funzione di BATF2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di BATF2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal BATF2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal BATF2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus BATF2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal BATF2 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR BATF2 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia BATF2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio BATF2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.