BANP CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-412401

Übersicht

BANP (BTG3-assoziiertes nukleäres Protein), auch bekannt als SMAR1, ist ein nukleärer DNA-bindender Faktor, der an der Chromatinorganisation und der Transkriptionskontrolle an Matrix-Anheftungsregionen beteiligt ist. Es wurde mit der Regulation des Zellzyklusfortschritts, von Checkpoint-Antworten und der Aufrechterhaltung der Genomstabilität in Verbindung gebracht, indem es Transkriptionsprogramme und DNA-schadensassoziierte Prozesse koordiniert. Die BANP-Aktivität überschneidet sich mit Chromatin-Remodeling- und tumorsuppressorassoziierten Signalnetzwerken und beeinflusst dadurch Proliferation sowie stressinduzierte Genexpression. Eine Fehlregulation der BANP-Expression oder -Funktion wurde mit verändertem Wachstumskontrollverhalten und Phänotypen der Genomintegrität assoziiert, die für die Krebsbiologie und entsprechende zelluläre Modelle relevant sind.

Das BANP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des BANP-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des BANP-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von BANP nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die BANP-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von BANP-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der BANP-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf BANP-Exone abzielen, die für die BANP-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere BANP-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom BANP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom BANP CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des BANP-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das BANP HDR-Plasmid (h) und BANP HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von BANP-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten BANP-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.