Les inhibiteurs chimiques de ZNF613 agissent par le biais de divers mécanismes moléculaires pour entraver sa fonction. L'alsterpaullone est un inhibiteur de la kinase cycline-dépendante, qui perturbe les CDK potentiellement essentielles au rôle de ZNF613 dans la régulation de la transcription, entravant ainsi sa capacité fonctionnelle dans l'expression des gènes. La chélérythrine cible la protéine kinase C, qui peut phosphoryler des substrats modulant l'activité de ZNF613. En inhibant cette kinase, l'état de phosphorylation et donc l'activité de ZNF613 peuvent être modifiés, ce qui conduit à son inhibition. En outre, le composé Y-27632, reconnu pour son inhibition de ROCK, peut perturber l'organisation et la dynamique du cytosquelette, ce qui peut être crucial pour la localisation de ZNF613 ou son activité transcriptionnelle, aboutissant à une réduction du rendement fonctionnel de ZNF613.
Pour détailler davantage l'inhibition chimique de ZNF613, le triptolide inhibe la voie NF-kB, qui pourrait faire partie intégrante de l'activité de ZNF613; en bloquant cette voie, la fonction de ZNF613 peut être inhibée. PD173074, un inhibiteur de la signalisation de la tyrosine kinase du FGFR, et ICG-001, un antagoniste de la transcription Wnt/β-caténine/TCF, entraînent tous deux la perturbation des voies de signalisation en amont dont l'activité de ZNF613 pourrait dépendre. Le SB431542 inhibe la signalisation des récepteurs du TGF-β, ce qui pourrait croiser les voies dépendant de ZNF613 et donc inhiber indirectement l'activité de ZNF613. L'inhibiteur du protéasome Bortezomib entraîne une accumulation de protéines ZNF613 mal repliées, ce qui peut nuire au bon fonctionnement de ZNF613. L'inhibition de la voie mTOR par la rapamycine peut réduire la synthèse des protéines qui interagissent avec ZNF613, ce qui a un impact sur sa fonction. Le LY294002 perturbe l'activité de PI3K et peut donc altérer la signalisation AKT, qui peut être cruciale pour la régulation de ZNF613. SP600125 cible JNK, affectant probablement les voies de signalisation dépendant de ZNF613, ce qui conduit à son inhibition. L'inhibiteur de NUAK1 WZ4003 peut altérer les fonctions cellulaires régulées par ZNF613, conduisant à son inhibition fonctionnelle.
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