Les inhibiteurs chimiques de ZFP96 peuvent être compris à travers le prisme des différentes voies de signalisation qui régulent son activité. Le phorbol 12-myristate 13-acétate (PMA) active directement la protéine kinase C (PKC), qui peut à son tour phosphoryler ZFP96, ce qui conduit à son inhibition. Cette phosphorylation peut soit inactiver le ZFP96, soit le marquer pour la dégradation, diminuant ainsi sa présence fonctionnelle dans la cellule. De même, le GF109203X et le Gö6983 servent d'inhibiteurs de la PKC, empêchant la phosphorylation et les modifications régulatrices ultérieures de ZFP96 qui seraient normalement médiées par l'activité de la PKC. L'inhibition de la PKC empêche donc le cycle d'activation ou d'inactivation de ZFP96 qui dépend de cette modification post-traductionnelle.
Plus en amont, les voies des protéines kinases activées par les mitogènes (MAPK), qui comprennent les voies ERK, JNK et p38, sont des voies de régulation bien établies pour une multitude de protéines, y compris ZFP96. PD98059, U0126 et SL327 sont des inhibiteurs de MEK, une kinase en amont de la voie ERK. L'inhibition de MEK atténue la cascade de signalisation ERK, ce qui entraîne une diminution de l'activité fonctionnelle de ZFP96, qui dépend des événements de phosphorylation médiés par ERK. SP600125 et SB203580 ciblent respectivement les voies JNK et p38 MAPK. L'inhibition de ces kinases bloque l'activation des cibles en aval qui sont cruciales pour l'activité fonctionnelle de ZFP96. Ceci démontre une approche à plusieurs niveaux où l'inhibition à n'importe quel point de ces voies MAPK peut aboutir à la réduction de l'activité de ZFP96. D'autres inhibiteurs, comme le LY294002 et la Wortmannine, exercent leurs effets en inhibant la PI3K, qui est un précurseur de la voie de signalisation Akt. L'influence de la voie Akt sur l'activité de ZFP96 est considérable car elle implique une série d'événements de phosphorylation qui régulent le rôle de ZFP96 dans la cellule. En bloquant la PI3K, ces inhibiteurs empêchent la propagation des signaux nécessaires à l'activation de ZFP96. La rapamycine, en inhibant mTOR qui fait partie de la voie PI3K/Akt, diminue également les conditions nécessaires à une fonction optimale de ZFP96. Enfin, PP2 perturbe l'activité des kinases de la famille Src, qui peuvent également être impliquées dans la phosphorylation de ZFP96, ce qui illustre encore la nature interconnectée des voies de signalisation cellulaires et leur impact collectif sur la fonction de ZFP96.
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