Les inhibiteurs chimiques du TMEM138 peuvent agir par divers mécanismes pour perturber sa fonction dans les processus cellulaires, en particulier dans la ciliogenèse et la maintenance ciliaire. L'alsterpaullone, en tant qu'inhibiteur de la kinase cycline-dépendante, peut inhiber les voies de régulation du cycle cellulaire essentielles au bon fonctionnement du TMEM138, qui est crucial pour le développement ciliaire. De même, l'inhibition de la farnésyl pyrophosphate synthase par l'acide zolédronique peut altérer la prénylation, une modification post-traductionnelle nécessaire à l'association membranaire des protéines; TMEM138, qui est une protéine associée à la membrane ciliaire, peut voir sa fonction inhibée en raison d'une prénylation perturbée. L'action de la perhexiline sur la carnitine palmitoyltransférase 1 peut modifier le métabolisme des lipides, ce qui peut affecter la composition lipidique de la membrane ciliaire où TMEM138 est localisée, influençant ainsi sa fonction. La thapsigargin augmente les niveaux de calcium cytosolique en inhibant la pompe SERCA, ce qui pourrait affecter la ciliogenèse et la fonction du TMEM138 dans ce processus.
En outre, des inhibiteurs chimiques tels que la Brefeldine A peuvent perturber la fonction de Golgi et le trafic vésiculaire, essentiels pour le transport de protéines telles que le TMEM138 vers le cilium. La cytochalasine D peut inhiber le TMEM138 en interférant avec la polymérisation de l'actine, qui est nécessaire à la ciliogenèse et au trafic des protéines vers la base ciliaire. Dynasore affecte l'endocytose et le trafic vésiculaire en inhibant l'activité GTPase de la dynamine, ce qui pourrait perturber les voies de trafic essentielles à la fonction ciliaire de TMEM138. La colchicine se lie à la tubuline, empêchant sa polymérisation en microtubules, qui font partie intégrante de la structure ciliaire, ce qui pourrait inhiber la fonction du TMEM138 en raison de la perturbation de l'architecture des microtubules. L'inhibition par la chlorpromazine de la calmoduline, impliquée dans les voies de signalisation du calcium, peut influencer le rôle de TMEM138 dans la ciliogenèse. La génistéine, en inhibant la tyrosine kinase, peut affecter les voies de signalisation qui régulent la fonction ciliaire, où TMEM138 est impliqué. Enfin, la mitomycine C peut perturber la progression du cycle cellulaire en réticulant l'ADN, et le paclitaxel peut stabiliser de manière aberrante les microtubules; ces deux effets peuvent inhiber l'implication de TMEM138 dans la dynamique et la fonction ciliaire.
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