La stefine A3L1 peut engager diverses voies cellulaires pour renforcer l'activité de la protéine. Le phorbol 12-myristate 13-acétate (PMA) est un puissant activateur de la protéine kinase C (PKC), qui peut à son tour phosphoryler une série de substrats, dont la stéfine A3L1, modifiant ainsi sa conformation et sa fonction. De même, la forskoline augmente les niveaux d'AMP cyclique (AMPc) en activant l'adénylate cyclase, qui active ensuite la protéine kinase A (PKA). La PKA peut alors phosphoryler la stéfine A3L1, une modification post-traductionnelle qui active ou augmente généralement l'activité des protéines. Un autre composé, l'Ionomycine, agit comme un ionophore de calcium, élevant la concentration intracellulaire de calcium et activant potentiellement les kinases dépendantes du calcium qui peuvent phosphoryler et activer la stéfine A3L1.
La caliculine A et l'acide okadaïque entraînent une augmentation de l'état phosphorylé des protéines, ce qui peut entraîner l'activation de la stéfine A3L1. Dans le domaine des réponses au stress cellulaire, l'anisomycine active les protéines kinases activées par le stress, y compris JNK, qui peuvent phosphoryler et activer la protéine stefin A3L1. La thapsigargin, en inhibant l'ATPase Ca2+ du réticulum sarcoplasmique/endoplasmique (SERCA), provoque une augmentation du calcium cytosolique qui peut activer des kinases capables d'agir sur la stéfine A3L1. L'utilisation du 4β-Phorbol, qui active les isoformes de la PKC, et de la bryostatine 1, un autre activateur de la PKC, entraîne également la phosphorylation et l'activation subséquente de la stéfine A3L1. En outre, des composés comme le Dibutyryl-cAMP, un analogue de l'AMPc, activent la PKA, ce qui peut conduire à l'activation de la stéfine A3L1. Le gallate de (-)-épigallocatéchine (EGCG) s'engage dans des voies kinases, y compris la PKC, ce qui peut entraîner l'activation de la stéfine A3L1. Enfin, la sphingosine active la PKC, qui peut phosphoryler et donc activer la stéfine A3L1, complétant ainsi une série complète de mécanismes par lesquels l'activité de la stéfine A3L1 peut être modulée par l'utilisation de ces activateurs chimiques.
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