Inhibiteurs POLR2D

Les inhibiteurs courants de POLR2D comprennent, entre autres, l'α-Amanitine CAS 23109-05-9, le Triptolide CAS 38748-32-2, le DRB CAS 53-85-0, l'Actinomycine D CAS 50-76-0 et le Cordycepin CAS 73-03-0.

Les inhibiteurs chimiques de la sous-unité POLR2D de l'ARN polymérase II (Pol II) utilisent divers mécanismes pour entraver le processus de transcription. L'α-Amanitine, par exemple, cible directement la Pol II en se liant à elle et en empêchant l'enzyme de transcrire l'ADN en ARN messager (ARNm). Cette liaison est hautement spécifique et entraîne une forte inhibition de l'activité de l'enzyme.. L'action de l'α-Amanitine montre un effet profond sur la fonction de la sous-unité POLR2D, car POLR2D fait partie intégrante du complexe Pol II. Le triptolide, quant à lui, interfère avec la machinerie de transcription en se liant de manière covalente à la sous-unité XPB du complexe du facteur de transcription IIH (TFIIH), qui joue un rôle crucial dans l'initiation de la transcription. Cette liaison perturbe l'assemblage et la stabilité du complexe d'initiation, inhibant ainsi l'activité transcriptionnelle de la Pol II.

D'autres composés tels que le DRB, l'actinomycine D et la cordycépine présentent d'autres mécanismes d'action uniques. Le DRB agit en bloquant la phosphorylation du domaine C-terminal (CTD) de la plus grande sous-unité de la Pol II, qui est essentielle pour l'élongation des transcriptions. Cela affecte POLR2D en stoppant la progression de la polymérase le long de l'ADN. L'actinomycine D exerce son effet inhibiteur en s'intercalant dans l'ADN au niveau du complexe d'initiation de la transcription, empêchant ainsi la phase d'élongation de la transcription par l'ARN polymérase II. La cordycépine, un analogue nucléosidique, met fin à l'élongation de la chaîne d'ARNm en s'incorporant à la chaîne d'ARN en croissance. Ceci conduit à un arrêt prématuré du processus de transcription, affectant indirectement le rôle de POLR2D. Enfin, la tagetitoxine se lie au complexe d'initiation de la transcription et le stabilise, empêchant la transition vers la phase d'élongation, qui est essentielle pour l'activité de POLR2D dans le processus de transcription. Chacun de ces inhibiteurs, par le biais d'interactions distinctes avec la sous-unité POLR2D ou les complexes associés, entrave efficacement le processus global de transcription mené par l'ARN polymérase II.