Inhibiteurs PCDHA1

Les inhibiteurs courants de la PCDHA1 comprennent, sans s'y limiter, la trichostatine A CAS 58880-19-6, la 5-azacytidine CAS 320-67-2, le RG 108 CAS 48208-26-0, l'acide subéroylanilide hydroxamique CAS 149647-78-9 et la mithramycine A CAS 18378-89-7.

La classe chimique des inhibiteurs de PCDHA1 fait référence à un groupe de molécules qui interagissent avec la protéine codée par le gène PCDHA1, qui appartient au groupe de gènes de la protocadhérine alpha, un sous-ensemble de la superfamille des cadhérines, et qui en inhibent l'activité. Les protocadhérines sont des molécules d'adhésion cellulaire qui sont principalement exprimées dans le système nerveux et qui sont impliquées dans l'établissement et le maintien de connexions cellule-cellule spécifiques, essentielles au bon fonctionnement des circuits neuronaux. La fonction de PCDHA1, comme celle des autres protocadhérines, est d'assurer la médiation des interactions intercellulaires homophiles, c'est-à-dire des interactions entre des molécules identiques à la surface de cellules adjacentes. Les inhibiteurs de PCDHA1 se lient à la protéine d'une manière qui perturbe sa fonction adhésive, l'empêchant ainsi de jouer efficacement son rôle de médiateur de l'adhésion cellule-cellule. La conception et l'identification de tels inhibiteurs serait une tâche complexe, nécessitant une compréhension approfondie de la structure de la protéine, de la nature de ses interactions avec d'autres protéines de la surface cellulaire et des mécanismes précis par lesquels elle contribue à l'adhésion cellulaire.

L'identification des inhibiteurs de PCDHA1 impliquerait généralement un criblage à haut débit (HTS) pour tester de grandes bibliothèques de composés afin de déterminer leur capacité à perturber l'adhésion cellulaire médiée par PCDHA1. Cette capacité pourrait être observée au moyen de divers essais in vitro qui simulent les interactions cellule-cellule facilitées par PCDHA1. Les premiers résultats de ces criblages seraient des molécules qui montrent un potentiel dans la perturbation des interactions protéine-protéine. Ces molécules seront ensuite caractérisées pour leur spécificité, afin de s'assurer qu'elles n'interfèrent pas de manière non sélective avec d'autres membres de la famille des protocadhérines ou d'autres molécules d'adhésion cellulaire. Des analyses biochimiques et biophysiques détaillées, y compris des études d'affinité de liaison et des essais de compétition, seraient utilisées pour caractériser l'interaction entre les inhibiteurs et la PCDHA1. En outre, des études structurales, telles que la cristallographie aux rayons X ou la cryo-microscopie électronique, pourraient être utilisées pour élucider le mode précis d'interaction au niveau moléculaire.