Les inhibiteurs chimiques de la MBOAT2 comprennent l'Orlistat, qui est connu pour être un puissant inhibiteur de lipases. En inhibant les lipases, l'orlistat empêche le transfert des groupes acyles gras vers les glycérolipides, un processus clé régulé par la MBOAT2. Cette inhibition réduit effectivement l'activité fonctionnelle de la MBOAT2 en limitant sa capacité à participer au métabolisme des lipides. De même, la cérulénine et le C75 ciblent la voie de synthèse des acides gras. La cérulénine agit en inhibant l'acide gras synthase, réduisant ainsi les niveaux d'acides gras qui servent de substrats à la MBOAT2. La réduction de la disponibilité des substrats diminue directement l'action enzymatique de la MBOAT2. Le C75 fonctionne selon le même principe: l'inhibition de la synthase des acides gras entraîne une pénurie de substrats pour la MBOAT2, ce qui entrave son fonctionnement. L'acide bétulinique modifie la composition des lipides en inhibant la stéaroyl-CoA désaturase. Ces modifications peuvent entraîner une réduction du pool de substrats pour la MBOAT2, et la limitation consécutive de son activité souligne l'inhibition fonctionnelle conférée par l'acide bétulinique.
Outre ces inhibiteurs axés sur le substrat, la triacsine C cible l'acyl-CoA synthétase, ce qui entraîne une diminution du pool d'acyl-CoA. Cette réduction affecte directement la MBOAT2 qui dépend de ces molécules pour son activité enzymatique. L'inhibition par la tunicamycine de la glycosylation liée à l'azote, un processus essentiel pour le repliement et la fonction des protéines membranaires, pourrait nuire au bon fonctionnement de la MBOAT2. La suramine perturbe les interactions entre les facteurs de croissance et les récepteurs, ce qui peut entraîner une diminution de l'activité de la MBOAT2 en modifiant les voies de signalisation essentielles à sa fonction. PD 169316 et LY294002 agissent sur les voies kinases; PD 169316 inhibe p38 MAPK, réduisant potentiellement la phosphorylation et l'activité de MBOAT2, tandis que LY294002 inhibe la voie PI3K/AKT, affectant l'état de phosphorylation et l'activité de protéines telles que MBOAT2. Le GW4869 perturbe les niveaux de céramides et la structure des radeaux lipidiques, ce qui peut diminuer l'activité de la MBOAT2 en modifiant le microenvironnement lipidique crucial pour sa fonction. De même, la Filipine III se lie au cholestérol et modifie les radeaux lipidiques, ce qui peut inhiber l'activité de la MBOAT2. Enfin, la Brefeldine A perturbe l'appareil de Golgi et le trafic des protéines, ce qui peut inhiber la localisation et la fonction appropriées de la MBOAT2 au sein de l'architecture de la membrane cellulaire.
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