La staurosporine est un inhibiteur de kinases à large spectre capable de supprimer l'activité d'une multitude de kinases, ce qui peut avoir un impact sur de nombreuses voies de signalisation, entraînant potentiellement des changements dans l'activité des protéines. De même, la 5-azacytidine peut modifier l'expression des gènes par son action sur les ADN méthyltransférases, ce qui peut entraîner des modifications de la synthèse ou de la fonction des protéines. U0126 et PD98059 sont des inhibiteurs spécifiques de MEK1/2, et leur action peut perturber la cascade de signalisation MAPK/ERK, une voie connue pour réguler une variété de processus cellulaires, y compris la fonction des protéines.
La voie JNK, ciblée par SP600125, et la voie MAPK p38, ciblée par SB203580, sont essentielles pour répondre aux signaux de stress, et la modulation de ces voies peut influencer les protéines impliquées dans ces réponses. Le LY294002 peut inhiber la signalisation PI3K/AKT, une voie majeure qui régule la survie et le métabolisme des cellules, et peut donc affecter les protéines en aval de PI3K/AKT. Les inhibiteurs du protéasome comme le MG132 et le bortézomib peuvent empêcher la dégradation des protéines, ce qui entraîne des changements dans les niveaux et l'activité de diverses protéines cellulaires. La thapsigargin, en perturbant le SERCA, peut affecter l'homéostasie calcique, qui est cruciale pour de nombreux aspects de la fonction protéique, y compris le repliement et la signalisation. Le 2-Deoxy-D-glucose inhibe la glycolyse, ce qui peut avoir un impact sur le métabolisme énergétique et éventuellement affecter les protéines impliquées dans cette voie. Enfin, Z-VAD-FMK peut prévenir l'apoptose en inhibant les caspases, ce qui peut affecter l'activité des protéines régulées par les signaux apoptotiques.
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