LY294002 et U0126 jouent un rôle essentiel en perturbant les voies PI3K/Akt et MEK/ERK, respectivement. Cette perturbation lève la rétroaction négative qui maintient souvent l'activité des protéines sous contrôle, ce qui permet une activation plus robuste des protéines au sein de ces voies. Des composés comme le SB203580, le PD98059 et la rapamycine adoptent une approche similaire mais agissent sur des kinases différentes. Le SB203580 tempère la signalisation de la MAPK p38, tandis que le PD98059 cible la MEK1/2 et que la rapamycine interfère avec la signalisation de la mTOR. Ces inhibiteurs contribuent indirectement à une augmentation de l'activité des protéines régulées par ces kinases, créant un environnement dans lequel des protéines comme le FLJ45831 peuvent présenter une activité accrue.
La modulation des seconds messagers constitue une autre voie d'activation de FLJ45831. La forskoline, par exemple, catalyse la production d'AMPc, un second messager essentiel qui active la PKA, entraînant ensuite la phosphorylation des protéines cibles. L'ionomycine, en augmentant le calcium intracellulaire, déclenche l'activation des kinases dépendantes de la calmoduline, qui peuvent encore modifier les protéines et leur fonction. Le rôle de la PMA dans l'activation de la PKC entraîne également la phosphorylation des protéines, ce qui modifie leur activité. Les inhibiteurs de phosphatase tels que l'acide okadaïque et la caliculine A garantissent que les protéines restent phosphorylées en inhibant l'action des PP1 et PP2A. Cette phosphorylation soutenue est cruciale pour le maintien de l'activité des protéines. Inversement, le KN-93 et le Bisindolylmaleimide I, qui servent d'inhibiteurs de CaMKII et de PKC respectivement, peuvent conduire à une augmentation indirecte de l'activation des protéines en réduisant la rétroaction négative impliquant ces kinases.
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