On pense généralement que les protéines de la famille FAM90A se localisent dans le noyau, ce qui implique une implication potentielle dans des processus nucléaires tels que le remodelage de la chromatine, la régulation de l'expression génétique et le maintien de l'intégrité du génome. Compte tenu de sa localisation nucléaire putative, FAM90A3 peut interagir avec d'autres protéines nucléaires pour moduler l'activité transcriptionnelle, influencer la structure de la chromatine ou jouer un rôle dans le cycle cellulaire et les mécanismes de réparation de l'ADN.
La fonction de FAM90A3 peut également s'étendre à la régulation des processus cellulaires qui sont essentiels au développement, à la différenciation ou à l'apoptose. Par le biais d'interactions protéine-protéine potentielles, FAM90A3 pourrait influencer diverses voies de signalisation et réseaux transcriptionnels. Elle pourrait servir de cofacteur pour les facteurs de transcription ou faire partie d'un complexe multiprotéique qui régule les schémas d'expression génique essentiels aux fonctions cellulaires normales et aux réponses aux stimuli externes.Le profil d'expression de FAM90A3 dans différents tissus ou dans diverses conditions physiologiques peut fournir des indices sur sa fonction. Le profil d'expression de FAM90A3 dans différents tissus ou dans diverses conditions physiologiques peut fournir des indices sur sa fonction.
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