Les protéines de la famille FAM90A sont censées jouer un rôle dans le noyau, étant donné leur homologie de séquence avec d'autres protéines nucléaires, ce qui suggère que FAM90A20 pourrait participer à la dynamique de la chromatine, à la régulation de la transcription ou à la réparation de l'ADN. Il est possible que FAM90A20 soit impliqué dans le réseau complexe d'interactions protéine-protéine qui régit l'architecture de la chromatine et l'expression des gènes.
En raison de la nature conservée de ses séquences, FAM90A20 pourrait être impliquée dans des processus cellulaires critiques tels que le cycle cellulaire, la différenciation cellulaire ou l'apoptose. Elle pourrait avoir des domaines de liaison qui lui permettent d'interagir avec des facteurs de transcription spécifiques ou d'autres protéines nucléaires, modulant ainsi l'expression des gènes en réponse à des stimuli physiologiques ou environnementaux.Bien que le rôle précis de FAM90A20 reste à caractériser, des modèles d'expression différentielle dans les tissus ou en réponse à certaines conditions pourraient indiquer son importance physiologique. Son implication dans des voies spécifiques pourrait être déduite en étudiant ses partenaires d'interaction ou en observant les conséquences de sa surexpression ou de sa désactivation dans des modèles cellulaires ou animaux.
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