Les inhibiteurs de la FAM122B agissent par le biais de divers mécanismes indirects pour diminuer l'activité fonctionnelle de cette protéine en ciblant des voies de signalisation spécifiques et des processus cellulaires dans lesquels elle est impliquée. En inhibant les protéines kinases, certains composés peuvent supprimer les événements de phosphorylation qui sont essentiels pour l'activité et la régulation de la FAM122B, réduisant ainsi son rôle fonctionnel dans les systèmes cellulaires. Par exemple, l'inhibition de MEK1/2 et le blocage subséquent de la signalisation ERK perturbent l'une des voies potentielles par lesquelles la FAM122B peut être régulée. De même, en ciblant les voies de signalisation PI3K/Akt et mTORC1, d'autres inhibiteurs contribuent à une diminution de l'activité de la FAM122B en agissant sur les voies qui peuvent régir ses fonctions cellulaires, telles que le contrôle de la croissance et l'autophagie.
De plus, l'inhibition du métabolisme du glucose et des voies glycolytiques par des inhibiteurs spécifiques entraîne une réduction de l'apport énergétique, ce qui peut indirectement affecter les voies de signalisation et les processus biologiques dans lesquels FAM122B est impliquée. Il peut en résulter une diminution de l'activité fonctionnelle de la FAM122B en raison du rôle critique de l'énergie dans la régulation de diverses fonctions cellulaires. La perturbation de la structure et de la fonction de l'appareil de Golgi, ainsi que l'altération des voies de trafic intracellulaire, contribuent également à l'inhibition indirecte de la FAM122B, affectant son rôle potentiel dans ces processus cellulaires. En outre, la modulation des voies de réponse au stress en entravant la signalisation p38 MAPK et JNK et l'inhibition de l'activité de la calcineurine peut réduire l'activité fonctionnelle de la FAM122B, car ces voies peuvent jouer un rôle déterminant dans la régulation du rôle de la FAM122B dans la cellule. Enfin, la perturbation du potentiel de la membrane mitochondriale par des agents de découplage peut entraîner une cascade d'événements cellulaires susceptibles d'influencer les voies associées à la FAM122B, réduisant ainsi son activité.
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