La staurosporine et la génistéine sont des inhibiteurs de kinases qui empêchent la phosphorylation des protéines, une modification post-traductionnelle qui régule souvent l'activité des protéines. La rapamycine et le LY294002 ciblent spécifiquement les composants de la voie PI3K/AKT/mTOR, un axe de signalisation clé qui contrôle la croissance et la survie des cellules, et pourraient donc affecter les protéines régulées par cette voie. En outre, le PD98059 et le SB203580 sont des inhibiteurs sélectifs des voies MAPK, qui sont essentielles pour la prolifération cellulaire, la différenciation et les réponses au stress.
Le NF449 perturbe la signalisation des récepteurs couplés aux protéines G, tandis que la Cyclopamine antagonise la voie Hedgehog, qui font toutes deux partie intégrante de nombreux processus cellulaires. Le ZM 447439 entrave l'action des kinases Aurora, qui sont essentielles à la division cellulaire, et pourrait affecter les protéines associées au cycle cellulaire. L'U73122 inhibe la phospholipase C, influençant les molécules de signalisation en aval et altérant potentiellement les protéines qui dépendent de la signalisation calcique. L'inhibiteur du protéasome Bortezomib est connu pour augmenter les niveaux de nombreuses protéines en empêchant leur dégradation, ce qui pourrait modifier l'abondance et l'activité de diverses protéines, y compris la D55. La thapsigargin perturbe les réserves de calcium en inhibant la pompe SERCA, ce qui pourrait affecter les protéines dépendantes du calcium.
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