Les inhibiteurs chimiques de la connexine 25 peuvent fonctionner selon différents mécanismes, chacun modifiant l'activité de la protéine de manière distincte. L'halothane, par exemple, s'incorpore dans la bicouche lipidique des membranes cellulaires, où se trouve la connexine 25, perturbant ainsi les propriétés physiques de la membrane. Cette altération peut entraver l'assemblage ou la fonction des canaux de la connexine 25, entraînant une diminution de la communication entre les jonctions lacunaires. De même, des alcools comme l'heptanol et l'octanol peuvent s'intégrer dans la bicouche lipidique et provoquer le découplage des jonctions lacunaires en modifiant la fluidité de la membrane et, potentiellement, en interagissant directement avec les protéines de la connexine, ce qui empêche la connexine 25 de former des canaux fonctionnels. Le chlorure de gadolinium(III), quant à lui, agit en bloquant directement les canaux de la jonction lacunaire, en inhibant le passage des ions et des petites molécules qui passent normalement par les canaux de la connexine 25.
D'autres substances chimiques, telles que la carbénoxolone et l'acide 18α-glycyrrhétinique, exercent leurs effets inhibiteurs en se liant aux canaux de jonction lacunaire de la connexine 25, en les bloquant et en réduisant ainsi la communication intercellulaire. Le composé 2-APB influence la signalisation calcique intracellulaire, qui est cruciale pour la régulation des jonctions lacunaires. En modifiant les niveaux de calcium, il peut empêcher la formation ou le maintien de canaux de connexine 25 fonctionnels. La méfloquine et la quinine interagiraient avec la protéine connexine 25 elle-même, modifiant ses propriétés de canal et réduisant ainsi la communication entre les jonctions lacunaires. Les bloqueurs non sélectifs de la jonction lacunaire, comme l'acide flufénamique et l'acide niflumique, inhibent la connexine 25 en empêchant l'échange d'ions et de molécules entre les cellules. Enfin, l'acide tannique a la capacité de précipiter les protéines et peut se lier directement aux protéines de la connexine, entraînant la fermeture des canaux de jonction lacunaire de la connexine 25, ce qui inhibe davantage la communication intercellulaire facilitée par ces canaux.
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