Les inhibiteurs du CCDC60 englobent un groupe diversifié de composés chimiques qui affectent diverses voies de signalisation et processus cellulaires, qui à leur tour peuvent indirectement inhiber l'activité fonctionnelle du CCDC60. Ces inhibiteurs ne ciblent pas directement le CCDC60 mais interfèrent avec les voies et les processus dans lesquels le CCDC60 est impliqué, en particulier ceux liés à la ciliogenèse et à la fonction ciliaire. Par exemple, les inhibiteurs de protéines kinases comme la staurosporine inhibent les kinases qui régulent la fréquence des battements ciliaires, affectant ainsi le rôle de CCDC60 dans la fonction ciliaire. Les inhibiteurs de kinases dépendantes des cyclines, comme la Roscovitine, peuvent empêcher l'assemblage ou la fonction des cils, où CCDC60 est impliqué, en arrêtant le cycle cellulaire. De même, l'inhibiteur de la kinase Raf GW5074 et l'inhibiteur de la MEK PD98059 perturbent la voie MAPK/ERK, altérant ainsi potentiellement les activités de CCDC60 liées aux cils.
Des composés comme le LY294002 et la rapamycine ciblent respectivement les voies PI3K/Akt et mTOR, qui sont toutes deux essentielles à la ciliogenèse et à la fonction ciliaire, processus dans lesquels CCDC60 joue un rôle fonctionnel. Les inhibiteurs de la dynamique du cytosquelette, tels que Blebbistatin et Y-27632, interfèrent avec l'organisation de l'actine et de la myosine II, qui est essentielle à l'assemblage et à la fonction ciliaires, affectant ainsi les activités associées de CCDC60.
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