Les inhibiteurs chimiques de C6orf58 peuvent être divers et avoir un impact sur l'activité de la protéine par le biais de diverses voies de signalisation cellulaire. La staurosporine est un inhibiteur de protéine kinase à large spectre, qui peut inhiber C6orf58 si la fonction de la protéine est modulée par des événements de phosphorylation contrôlés par ces kinases. De même, si C6orf58 fait partie de la voie PI3K/AKT ou est régulé par elle, des inhibiteurs tels que Wortmannin ou LY294002 peuvent interrompre cette signalisation, entraînant l'inhibition de C6orf58. La rapamycine, qui cible la voie mTOR - un régulateur central de la croissance et de la prolifération cellulaires - peut également inhiber le gène C6orf58 s'il est impliqué dans cette voie de signalisation. En outre, PD98059 et U0126 sont des inhibiteurs sélectifs de MEK1/2, composants de la voie MAPK/ERK, et peuvent inhiber le gène C6orf58 s'il opère en aval de ces kinases ou est régulé par elles.
La voie JNK, impliquée dans des processus tels que l'apoptose, peut être ciblée par SP600125, ce qui pourrait inhiber C6orf58 s'il est régulé par la signalisation JNK. De même, l'inhibition de la MAPK p38 par le SB203580 pourrait conduire à l'inhibition de C6orf58 si la protéine est un effecteur en aval. Les kinases de la famille Src, qui jouent un rôle dans diverses voies de signalisation, peuvent être inhibées par le dasatinib et la PP2. Cette inhibition peut s'étendre à C6orf58 s'il est sous le parapluie régulateur de la signalisation Src. Enfin, la PKC est une autre kinase qui peut être inhibée par le Bisindolylmaleimide I et le Go6983, ce qui inhiberait le C6orf58 si l'activité de la protéine dépend d'événements de phosphorylation ou d'interactions protéiques dépendant de la PKC. Ces produits chimiques fournissent un spectre de mécanismes qui peuvent converger vers l'inhibition fonctionnelle de C6orf58 par l'interruption de voies de signalisation spécifiques qui régulent ou influencent l'activité de la protéine.
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