Le domaine des activateurs du C17orf59 dépend largement du jeu complexe des processus cellulaires entourant les endosomes et les lysosomes. La chloroquine, connue pour moduler le pH lysosomal, et la bafilomycine A1, un inhibiteur spécifique de la H+-ATPase de type vacuolaire, peuvent toutes deux créer des effets d'entraînement dans la fonctionnalité lysosomale, affectant ainsi les processus associés à BORCS6. Étant donné l'association de BORCS6 avec ces organites, des produits chimiques tels que l'U18666A, qui perturbent le transport intracellulaire du cholestérol, peuvent jeter une ombre indirecte sur l'activité de BORCS6.
L'endocytose et le trafic vésiculaire jouent un rôle central dans les voies auxquelles BORCS6 est associé. Des agents tels que Wortmannin, Dynasore et EIPA, qui ciblent divers composants des processus endocytaires, sont donc sous les feux de la rampe. L'influence de ces composés sur l'endocytose et les mouvements vésiculaires crée un environnement propice à la modulation de l'activité de BORCS6. De même, la génistéine et le LY294002, en inhibant des kinases cellulaires spécifiques, façonnent le paysage endocytaire, guidant indirectement les processus de BORCS6.
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