Les inhibiteurs chimiques d'ANKRD23 ciblent la protéine par divers mécanismes directs et indirects qui dépendent des processus cellulaires et des voies biochimiques spécifiques dans lesquels ANKRD23 est impliqué. La staurosporine, un inhibiteur de protéine kinase à large spectre, peut empêcher la phosphorylation d'ANKRD23. Cette inhibition pourrait maintenir ANKRD23 dans un état inactif. De même, l'ivermectine peut modifier l'équilibre ionique, entraînant la perte de l'activité d'ANKRD23. La Brefeldine A peut perturber les voies de transport intracellulaire; si ANKRD23 nécessite une translocation pour fonctionner efficacement, ce produit chimique entraînerait son inhibition fonctionnelle en raison d'une mauvaise localisation.
En outre, le MG132 peut entraîner l'accumulation de protéines régulatrices qui régissent l'activité d'ANKRD23 en inhibant le protéasome, qui pourrait autrement dégrader ces régulateurs. Cette accumulation peut inhiber ANKRD23. La ciclosporine A, par son inhibition de la calcineurine, peut maintenir ANKRD23 dans un état phosphorylé et potentiellement inactif si la déphosphorylation est nécessaire à sa fonction. Le LY294002 et la Rapamycine, inhibiteurs des voies PI3K et mTOR, respectivement, peuvent diminuer l'activité de l'ANKRD23. U0126 et PD98059 se concentrent sur la voie MAPK/ERK, son activité serait réduite par ces produits chimiques. Le WZB117, qui inhibe le transport du glucose, peut supprimer la fonction d'ANKRD23 en limitant l'apport d'énergie nécessaire à son activité. La thapsigargin, en perturbant l'homéostasie du calcium, peut inhiber ANKRD23. Enfin, KN-93 inhibe spécifiquement CaMKII, ce qui pourrait entraîner une inhibition fonctionnelle d'ANKRD23.
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