Plasmide CRISPR/Cas9 KO ZNF580 (h): sc-406194

Présentation

ZNF580 est une protéine à doigts de zinc C2H2 contenant un domaine KRAB, qui agit principalement comme régulateur transcriptionnel, en reliant la liaison à l’ADN spécifique de séquence à des complexes de modification de la chromatine qui façonnent les programmes d’expression génique. Elle a été impliquée dans le contrôle du comportement des cellules endothéliales, notamment la migration et les réponses angiogéniques, ainsi que dans la coordination des réponses au stress oxydatif et des signaux inflammatoires. Par ces fonctions régulatrices, ZNF580 peut influencer des voies contrôlant le remodelage vasculaire, la progression du cycle cellulaire et la transcription induite par le stress. Une expression ou une activité dérégulée de ZNF580 a été associée à des contextes de pathologie vasculaire, tels que des processus liés à l’athérosclérose et une dysfonction endothéliale associée à l’ischémie, ce qui en fait une cible pertinente pour des études mécanistiques en biologie vasculaire.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO ZNF580 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène ZNF580 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du ZNF580, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert ZNF580 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine ZNF580.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en ZNF580 pour l'étude de la signalisation de ZNF580, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de ZNF580 essentiels à la fonction de ZNF580
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de ZNF580 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le ZNF580 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le ZNF580 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus ZNF580. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le ZNF580 plasmide HDR (h) et le ZNF580 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie ZNF580 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles ZNF580 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.