UBXN2B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-407871

Visão geral

UBXN2B (proteína do domínio UBX 2B) é um adaptador da família UBX implicado no controlo de qualidade proteica dependente de ubiquitina, ao ligar substratos poliubiquitinados à ATPase AAA+ p97/VCP para extração e processamento proteassomal a jusante. Através deste papel, a UBXN2B contribui para a regulação da degradação associada ao retículo endoplasmático (ERAD), para a eliminação de proteínas mal dobradas ou danificadas e para a manutenção da proteostase durante o stress celular. A perturbação das redes de cofatores p97–UBX é amplamente relevante para vias que governam a progressão do ciclo celular, as respostas a danos no ADN e a sinalização de stress, que moldam a viabilidade celular e os programas de diferenciação. Como um nó na circuitaria do sistema ubiquitina–proteassoma (UPS), a UBXN2B é de interesse para estudos mecanísticos em contextos em que o desequilíbrio da proteostase e a depuração anómala de proteínas contribuem para fenótipos relevantes para a doença.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO UBXN2B (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene UBXN2B em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do UBXN2B, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do UBXN2B na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína UBXN2B.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de UBXN2B para a investigação da sinalização de UBXN2B, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) UBXN2B críticos para a função UBXN2B
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos UBXN2B para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo UBXN2B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo UBXN2B Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus UBXN2B. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo UBXN2B Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR UBXN2B (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia UBXN2B para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo UBXN2B definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.