Sox-1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-423077

Descripción general

Sox1 codifica el factor de transcripción Sox-1, una proteína de unión al ADN con dominio HMG-box que actúa de manera temprana en la especificación del neuroectodermo y en el mantenimiento de la identidad de los progenitores neurales durante el desarrollo del ratón. Sox-1 regula programas de expresión génica que controlan decisiones de destino celular, proliferación y diferenciación dentro del sistema nervioso central, integrándose con redes transcripcionales más amplias mediadas por SoxB1 y con vías que pautan el tubo neural. Los programas asociados a SOX1 desregulados se estudian en el contexto de trayectorias neurodesarrollativas aberrantes y de falta de fidelidad de linaje en tumores derivados de tejido neural, donde los cambios entre estados progenitores y diferenciados pueden influir en fenotipos relevantes para la enfermedad. Como regulador del desarrollo, Sox-1 se utiliza con frecuencia como marcador y como nodo mecanístico para modelar el compromiso neural en sistemas de biología de células madre y biología del desarrollo.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Sox-1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Sox1 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Sox1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Sox1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Sox-1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Sox1 para la investigación de la señalización de Sox-1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Sox1 críticos para la función de Sox-1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Sox1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Sox-1 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido Sox-1 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Sox1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Sox-1 (m) y el plásmido HDR Sox-1 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Sox1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Sox1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.