Sox-1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-401473

Descripción general

SOX1 codifica el factor de transcripción Sox-1, un miembro de la familia SOXB1 que se expresa de forma destacada en el neuroectodermo y en poblaciones de progenitores neurales. Sox-1 se une al ADN mediante su dominio HMG box para regular programas génicos que controlan la especificación neural, el mantenimiento de los progenitores y el momento de la diferenciación, interactuando con redes de señalización del desarrollo y de regulación de la cromatina. En las vías celulares, SOX1 contribuye a circuitos transcripcionales que coordinan la neurogénesis y la restricción de linaje, incluyendo el crosstalk con procesos de patrón asociados a Notch, Wnt y SHH. La desregulación de la expresión de SOX1 se ha vinculado a estados del desarrollo aberrantes y se estudia en contextos como tumores de linaje neural y síndromes neurológicos asociados a autoanticuerpos, lo que lo convierte en un nodo útil para la investigación mecanística.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Sox-1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SOX1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SOX1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SOX1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Sox-1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SOX1 para la investigación de la señalización de Sox-1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SOX1 críticos para la función de Sox-1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SOX1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Sox-1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido Sox-1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SOX1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Sox-1 (h) y el plásmido HDR Sox-1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SOX1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SOX1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.