SLIRP Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-418350

Descripción general

SLIRP (proteína de unión a ARN que interactúa con la estructura tallo-bucle, por sus siglas en inglés) es un pequeño factor mitocondrial de unión a ARN que se asocia con LRPPRC para estabilizar y coordinar el procesamiento posranscripcional de los ARNm codificados por la mitocondria. Al mantener la homeostasis de los transcritos mitocondriales, SLIRP contribuye a la capacidad de fosforilación oxidativa (OXPHOS) y a la función de la cadena respiratoria, influyendo en el metabolismo energético celular y en las respuestas al estrés mitocondrial. La alteración de SLIRP puede desorganizar los programas de expresión génica mitocondrial y se ha vinculado a fenotipos de disfunción mitocondrial relevantes para mecanismos de enfermedad neuromuscular y metabólica. Por ello, SLIRP se estudia en vías que conectan la regulación del ARN mitocondrial, la proteostasis y la adaptación bioenergética.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO SLIRP (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SLIRP en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SLIRP junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SLIRP tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína SLIRP.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SLIRP para la investigación de la señalización de SLIRP, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SLIRP críticos para la función de SLIRP
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SLIRP para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido SLIRP CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido SLIRP CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SLIRP. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR SLIRP (h) y el plásmido HDR SLIRP (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SLIRP para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SLIRP definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.