Plasmide CRISPR/Cas9 KO SFXN2 (h): sc-414132

Présentation

SFXN2 (sideroflexine 2) est un transporteur de la membrane interne mitochondriale impliqué dans le maintien de l’homéostasie métabolique mitochondriale et le soutien des processus liés à la phosphorylation oxydative. En tant que membre de la famille des sideroflexines, il est associé à des fonctions de transport qui influencent le métabolisme à un carbone, l’utilisation des acides aminés et l’équilibre rédox, affectant ainsi la respiration mitochondriale et la gestion des espèces réactives de l’oxygène. Des altérations du transport mitochondrial et de l’état bioénergétique peuvent moduler la signalisation du stress, les voies de l’immunité innée et les décisions de destinée cellulaire. Par conséquent, SFXN2 suscite l’intérêt dans les domaines de recherche reliant le dysfonctionnement mitochondrial à des phénotypes cardiométaboliques et liés à la neurodégénérescence, ainsi qu’au remodelage métabolique des cellules cancéreuses.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SFXN2 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SFXN2 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SFXN2, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SFXN2 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SFXN2.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SFXN2 pour l'étude de la signalisation de SFXN2, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SFXN2 essentiels à la fonction de SFXN2
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SFXN2 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SFXN2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SFXN2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SFXN2. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SFXN2 plasmide HDR (h) et le SFXN2 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SFXN2 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SFXN2 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.