SETMAR Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-417901

Descripción general

SETMAR (también conocida como Metnase) es una metiltransferasa de lisina humana que contiene un dominio SET y está fusionada a un dominio derivado de una transposasa mariner, lo que coordina la modificación de la cromatina con el procesamiento de los extremos del ADN. Participa en la reparación de roturas de doble cadena del ADN y en el mantenimiento del genoma al modular la unión de extremos no homóloga (NHEJ) e influir en las respuestas al estrés asociado a la replicación. A través de interacciones con factores de reparación y componentes de la cromatina, SETMAR puede afectar la regulación transcripcional y la accesibilidad de la cromatina en los sitios de daño. La actividad o expresión desregulada de SETMAR se ha asociado con una capacidad de reparación del ADN alterada y con inestabilidad genómica, lo que la hace relevante para estudios de biología del cáncer, radiosensibilidad y mecanismos de respuesta a fármacos.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO SETMAR (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SETMAR en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SETMAR junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SETMAR tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína SETMAR.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SETMAR para la investigación de la señalización de SETMAR, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SETMAR críticos para la función de SETMAR
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SETMAR para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido SETMAR CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido SETMAR CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SETMAR. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR SETMAR (h) y el plásmido HDR SETMAR (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SETMAR para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SETMAR definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.