RPRD1B Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-412911

Descripción general

RPRD1B codifica un regulador que interactúa con el CTD de la ARN polimerasa II y ayuda a coordinar el inicio, la elongación y la terminación de la transcripción mediante la modulación de los estados de fosforilación del CTD de la polimerasa. Al vincular el control transcripcional con el procesamiento del ARNm, RPRD1B contribuye a programas globales de expresión génica, incluidas redes transcripcionales del ciclo celular y de respuesta al estrés. La expresión o función desregulada de RPRD1B se ha asociado con una homeostasis transcripcional alterada observada en contextos relacionados con el cáncer, donde los cambios en la dinámica de la ARN polimerasa II pueden afectar la proliferación y la estabilidad del genoma. Como regulador transcripcional nuclear, también es relevante para estudios mecanísticos del procesamiento de ARN acoplado a la transcripción y de la regulación asociada a la cromatina.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO RPRD1B (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen RPRD1B en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del RPRD1B junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de RPRD1B tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína RPRD1B.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en RPRD1B para la investigación de la señalización de RPRD1B, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de RPRD1B críticos para la función de RPRD1B
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de RPRD1B para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido RPRD1B CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido RPRD1B CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus RPRD1B. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR RPRD1B (h) y el plásmido HDR RPRD1B (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología RPRD1B para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana RPRD1B definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.