PSIP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404589

Übersicht

PSIP1 (auch bekannt als LEDGF/p75) ist ein chromatinassoziierter transkriptioneller Kofaktor, der über seine PWWP-Domäne an H3K36me3-markierte aktive Gene bindet und zur Organisation der Transkriptionselongation, der RNA-Prozessierung und von DNA-Schadensantworten beiträgt. Durch die Interaktion mit Faktoren, die an Replikationsstress und der Reparatur von Doppelstrangbrüchen beteiligt sind, trägt PSIP1 zur Genomstabilität und zum Überleben von Zellen unter genotoxischen Bedingungen bei. PSIP1 ist außerdem dafür bekannt, virale Integrase an Chromatin zu verankern, wodurch die Auswahl von Integrationsstellen beeinflusst wird, und es ist an Regulationsprogrammen beteiligt, die mit onkogener Transkription und zellulärer Stresssignalgebung verknüpft sind. Eine Fehlregulation PSIP1-assoziierter Chromatininteraktionen wurde in Zusammenhängen wie hämatologischen Malignomen und anderen Krebsarten untersucht, in denen die Transkriptionskontrolle und das Gleichgewicht der Reparaturwege verändert sind.

Das PSIP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PSIP1-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PSIP1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PSIP1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PSIP1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PSIP1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PSIP1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PSIP1-Exone abzielen, die für die PSIP1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PSIP1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PSIP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom PSIP1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PSIP1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PSIP1 HDR-Plasmid (h) und PSIP1 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PSIP1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PSIP1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.