PHF6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-427858

Übersicht

Das murine Gen *Phf6* kodiert PHF6, ein nukleäres PHD-ähnliches Zinkfingerprotein, das als chromatinassoziierter Regulator der Transkription und der RNA-Biogenese fungiert. PHF6 ist an der epigenetischen Kontrolle der Genexpression beteiligt, indem es mit Chromatin-Remodelling- und histonmodifizierenden Komplexen interagiert und dadurch linienspezifische Transkriptionsprogramme, die Zellzyklusprogression und die Differenzierung beeinflusst. Störungen PHF6-abhängiger regulatorischer Netzwerke wurden mit veränderten hämatopoetischen und neuroentwicklungsbezogenen Prozessen in Verbindung gebracht, was *Phf6* zu einem geeigneten Knotenpunkt für die Untersuchung transkriptioneller Fehlregulation macht. In Mausmodellen wird die Störung von *Phf6* häufig im Zusammenhang mit Genomstabilität, Chromatinorganisation und krankheitsrelevanten Genexpressionssignaturen untersucht.

Das PHF6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Phf6-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Phf6-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Phf6 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die PHF6-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Phf6-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der PHF6-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Phf6-Exone abzielen, die für die PHF6-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Phf6-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom PHF6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom PHF6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Phf6-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das PHF6 HDR-Plasmid (m) und PHF6 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Phf6-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Phf6-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.