NUDT21 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-402082

Descripción general

NUDT21 codifica una subunidad central del complejo factor de corte Im (CFIm), que reconoce motivos UGUA y favorece el procesamiento del extremo 3′ y la poliadenilación de los pre-ARNm. Al influir en la elección de sitios alternativos de poliadenilación, NUDT21 ayuda a controlar la longitud de la UTR 3′, la estabilidad del ARNm y la producción traduccional, moldeando así programas de expresión génica vinculados a la proliferación, la diferenciación y las respuestas al estrés. La actividad alterada de NUDT21 se asocia con cambios generalizados en la poliadenilación alternativa que pueden remodelar redes regulatorias, incluido el control mediado por microARN y las interacciones con proteínas de unión a ARN. La desregulación de estas vías de procesamiento de ARN se ha implicado en diversos contextos relevantes para enfermedades, como la remodelación del transcriptoma asociada al cáncer y fenotipos del neurodesarrollo.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO NUDT21 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen NUDT21 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del NUDT21 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de NUDT21 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína NUDT21.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en NUDT21 para la investigación de la señalización de NUDT21, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de NUDT21 críticos para la función de NUDT21
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de NUDT21 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido NUDT21 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido NUDT21 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus NUDT21. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR NUDT21 (h) y el plásmido HDR NUDT21 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología NUDT21 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana NUDT21 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.